主要的治疗应取决于垂体功能衰竭的原因，若为垂体肿瘤导致的垂体前叶功能低下，应根据病情考虑外科手术治疗或放射治疗。
　　激素缺乏者应作长期激素替代治疗。
　　一、tsh缺乏　可用l－甲状腺素100～200μg／日，开始50μg／日，逐渐增量，或用甲状腺片40～80mg/日，开始20mg／日。或三碘甲腺原氨酸10～20μg／日，逐渐增至50～75μg/日。用药后甲状腺功能低下之症状逐渐恢复即表明治疗有效。治疗中应随时注意心率，以免药物过量。
　　二、acth缺乏 肾上腺皮质激素替代治疗应先于甲状腺激素治疗，以免因代谢率提高而诱发肾上腺危象。氢化可的松，上午20mg，下午10mg。强的松，上午5mg，下午2.5或可的松，上午25mg，下午12.5mg。重症可酌情加大剂量，待病情好转后再减量调整。如有感染、手术、外伤等应激时，亦应加大剂量，并随病情的好转而逐渐减量。一般情况下不用盐皮质激素，因为本病患者醛固酮分泌未必减少。不恰当地应用盐皮质激素可致水肿、高血压、少尿、与心力衰竭等。
　　三、gh缺乏　一般只有骨骺闭合前用gh，以保证青春期前的患者正常地生长。目前使用较多的是基因重组gh，5～19mg，每周1～3次肌肉注射，维持2年以上。
　　四、gn缺乏 男性患者可用睾酮制剂替代。甲基睾丸酮，每日10～30mg，分2、3次舌下含服。或用丙酸睾丸酮，每次25mg，每周1～2次肌肉注射。或庚酸睾酮250mg，肌肉注射，每2～3周1次，或11烷酸睾酮（testpsterone undeconoate)80mg，一日2次口服。
　　促进精子生成，需合用pergonai（含fsh和lh各75iu）和绒毛膜促性腺激素（hcg）。pergonal每次500～2000iu每周肌注3次，疗程至少3个月（精子生成周期为3个月）。hcg每次500～1000u，每周肌注1～2次。
　　病变在下丘脑时，可用lhrh泵间歇输注。
　　女性患者可用已烯雌酚0.5～1.0mg,一日1次，每月服20天，第16天加用黄体酮，10mg肌肉注射，一日1次，共5天，育龄妇女如欲再次时，可肌注pergonai和hcg。